MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE04

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017447	GCC	2	6	76	81	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785425
2	NC_017447	GCT	3	9	83	91	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785425
3	NC_017447	ACGCCA	2	12	94	105	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385785425
4	NC_017447	GCCG	2	8	111	118	0 %	0 %	50 %	50 %	385785425
5	NC_017447	CTGC	2	8	128	135	0 %	25 %	25 %	50 %	385785425
6	NC_017447	AGC	2	6	148	153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785425
7	NC_017447	TGC	2	6	155	160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785425
8	NC_017447	CGG	2	6	194	199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785425
9	NC_017447	CTG	2	6	252	257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785425
10	NC_017447	TGG	2	6	283	288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785425
11	NC_017447	CGC	2	6	307	312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785425
12	NC_017447	TGA	2	6	316	321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785425
13	NC_017447	CGA	2	6	407	412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785426
14	NC_017447	GCCC	2	8	414	421	0 %	0 %	25 %	75 %	385785426
15	NC_017447	GCT	3	9	425	433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785426
16	NC_017447	CGA	3	9	503	511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785426
17	NC_017447	CGG	2	6	520	525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785426
18	NC_017447	GGA	2	6	977	982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785427
19	NC_017447	ACC	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785427
20	NC_017447	CTG	2	6	1044	1049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785427
21	NC_017447	CTG	2	6	1116	1121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785428
22	NC_017447	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785428
23	NC_017447	CGG	2	6	1172	1177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785428
24	NC_017447	CGC	2	6	1382	1387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785429
25	NC_017447	CGTG	2	8	1409	1416	0 %	25 %	50 %	25 %	385785429
26	NC_017447	GCG	2	6	1419	1424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785429
27	NC_017447	CGG	2	6	1552	1557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785430
28	NC_017447	CCG	2	6	1607	1612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785430
29	NC_017447	GAC	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785430
30	NC_017447	GCA	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785430
31	NC_017447	CAC	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785430
32	NC_017447	GCA	2	6	1703	1708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785430
33	NC_017447	GCT	2	6	1709	1714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785430
34	NC_017447	CTT	2	6	1745	1750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785430
35	NC_017447	CGG	2	6	1757	1762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785430
36	NC_017447	GCT	2	6	1769	1774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785430
37	NC_017447	GCC	2	6	1801	1806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785430
38	NC_017447	AGC	2	6	1807	1812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785430
39	NC_017447	GCC	2	6	1863	1868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785430
40	NC_017447	ATCG	2	8	1980	1987	25 %	25 %	25 %	25 %	385785431
41	NC_017447	GC	3	6	1995	2000	0 %	0 %	50 %	50 %	385785431
42	NC_017447	CGG	2	6	2006	2011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785431
43	NC_017447	GCC	2	6	2016	2021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785431
44	NC_017447	CGC	2	6	2044	2049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785431
45	NC_017447	TGA	2	6	2077	2082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785431
46	NC_017447	CTG	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785431
47	NC_017447	CTG	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785431
48	NC_017447	GCG	3	9	2154	2162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785431
49	NC_017447	GGT	2	6	2171	2176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785431
50	NC_017447	GC	3	6	2178	2183	0 %	0 %	50 %	50 %	385785431
51	NC_017447	ACG	2	6	2185	2190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785431
52	NC_017447	TGC	2	6	2191	2196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785431
53	NC_017447	GGT	2	6	2237	2242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785431
54	NC_017447	GAC	2	6	2283	2288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785431
55	NC_017447	GCT	2	6	2309	2314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785431
56	NC_017447	CAGC	2	8	2558	2565	25 %	0 %	25 %	50 %	385785432
57	NC_017447	AGG	2	6	2572	2577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785432
58	NC_017447	GC	3	6	2718	2723	0 %	0 %	50 %	50 %	385785433
59	NC_017447	GGT	2	6	2801	2806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785433
60	NC_017447	TGC	2	6	2818	2823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785433
61	NC_017447	GCC	2	6	2827	2832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785433
62	NC_017447	GGCCG	2	10	2837	2846	0 %	0 %	60 %	40 %	385785433
63	NC_017447	TGTT	2	8	2869	2876	0 %	75 %	25 %	0 %	385785433
64	NC_017447	CGCTGC	2	12	2881	2892	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385785433
65	NC_017447	ACGC	2	8	2937	2944	25 %	0 %	25 %	50 %	385785433

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.